Kabupaten Natuna terletak di antara 2^oLU sampai dengan 5^oLU dan dari 104^oBT sampai dengan 110^oBT, terdiri dari daratan dan perairan dengan luas wilayahnya mencapai 141.901 km2 dengan luas daratan 3.235,2 km2 dan lautan 138.666 km2.

Wilayah Kabupaten Natuna terdapat 271 pulau besar dan kecil, tiga pulau besar diantaranya Pulau Bunguran, Pulau Jemaja dan Pulau Serasan.

Kabupaten Natuna memiliki batas wilayah sebagai berikut:

• Sebelah Utara dengan Vietnam dan Kamboja;
• Sebelah Selatan dengan Kabupaten Kepulauan Riau;
• Sebelah Timur dengan Malaysia Timur dan Kalimantan Barat;
• Sebelah Barat dengan Semenanjung Malaysia dan Pulau Bintan Kabupaten Kepualaun Riau.

Berdasarkan kondisi geomorfologi, Kabupaten Natuna merupakan tanah berbukit dan bergunung batu. Dataran rendah dan landai banyak ditemukan dipinggir pantai. Ketinggian wilayah antar kecamatan cukup beragam, berkisar antara 3 m sampai 300 m dari permukaan laut dengan kemiringan 2 sampai 5 derajat, serta ada beberapa tempat terdapat lereng yang terjal.

Sedangkan struktur tanah pada umumnya terdiri dari tanah podsolik merah kuning dari batuan yang tanah dasarnya mempunyai bahan granit dan alluvial serta tanah organosol dan gley humus.

Iklim di Kabupaten Natuna sangat dipengaruhi oleh perubahan arah angin. Musim kemarau biasanya terjadi pada bulan Maret dan Mei, ketika angina dari arah utara bertiup. Musim hujan terjadi pada bulan September sampai dengan Februari ketika arah angin bertiup dari Timur dan Selatan.

Curah hujan rata-rata setahun 2.000 mm3 dengan kelembaban udara sekitar 85% dan temperatur 25^o, dengan suhu udara berkisar antara 21^o - 34^o.

Sumber:
http://www.natuna.go.id/id/sekilas/geo.php